本校の校章は、旧上原小中学校の校章のデザインを継承したものである。
昭和４０年、船浦中学校として統合された当時、新しいデザインで校章を設定しようとの提案もなされたが、その象徴する意味と伝統を引き継ぐ立場から現校章が制定された。

　その、象徴する意味は下記の通りである。

                            　　　　　　

　　　●  ペン………………………………………………………　学問愛好・真理探究の精神

　　　●  クワ………………………………………………………　勤労愛好・郷土開拓の精神

　　　●  三つのペンとクワ…………………………………　校訓の自主・努力・親愛を示す

　　　●  ペンとクワを合わせた六…………………………………………　校区と学校を表す

　　　●  ペンとクワ…………………………………………………………………　努力の精神

　　　●  学校と集落を合わせた六つの数…………………………………………　親愛の精神

　　　●  努力の精神と親愛を象徴する全体の姿…………………………………　自主の精神

　ペンとクワの組み合わせは「学問と勤労」との一体、「理論と実践」との一致を表し、本校卒業後、生徒達が真に社会の有能な人物となるようにという願いを表している。

　ペンとクワは「努力」の精神を象徴し、校訓の自主・努力・親愛を示している。また、六角形は、校区の五集落と学校を合わせた数の六からきており、地域と学校が手を取り合うという「親愛」の精神を示している。

　※昭和２７年３月３０日制定　　作者：半嶺　當吉（当時の上原小中学校長）